Ngày 24/12/2013 Chính phủ ban hành Nghị định số 216/2013/NĐ-CP về tổ chức và hoạt động thanh tra ngành Kế hoạch và Đầu tư.

Theo đó, các cơ quan thực hiện chức năng thanh tra ngành Kế hoạch và Đầu tư gồm: Cơ quan thanh tra nhà nước (Thanh tra Bộ và Thanh tra Sở Kế hoạch và Đầu tư); cơ quan được giao thực hiện chức năng thanh tra chuyên ngành (Tổng cục Thống kê và Cục Thống kê).

Nội dung thanh tra hành chính gồm: Thanh tra việc chấp hành chính sách, pháp luật, nhiệm vụ, quyền hạn được giao của các cơ quan, tổ chức, cá nhân theo quy định của pháp luật; thanh tra việc chấp hành các quy định về quy hoạch tổng thể và kế hoạch phát triển kinh tế - xã hội.

Các nội dung thanh tra chuyên ngành thuộc thẩm quyền của Thanh tra ngành Kế hoạch và Đầu tư như: Quy hoạch, kế hoạch; phân bổ, quản lý và sử dụng vốn đầu tư phát triển; đấu thầu; đầu tư trong nước, đầu tư nước ngoài và đầu tư ra nước ngoài; việc tiếp nhận, quản lý và sử dụng nguồn hỗ trợ phát triển chính thức (ODA), nguồn vốn vay ưu đãi của các nhà tài trợ và viện trợ phi chính phủ nước ngoài; quản lý và hoạt động đối với khu công nghiệp, khu kinh tế, khu kinh tế cửa khẩu, khu công nghệ cao và các loại hình khu kinh tế khác; doanh nghiệp và đăng ký kinh doanh; hợp tác xã, liên hiệp hợp tác xã và thống kê.

Nghị định cũng quy định cụ thể về: Xây dựng và phê duyệt kế hoạch thanh tra hàng năm; thẩm quyền ra quyết định thanh tra; thời hạn thanh tra; về xử lý chồng chéo trong hoạt động thanh tra; thanh tra lại; tổng hợp, báo cáo công tác thanh tra ngành Kế hoạch và Đầu tư; thanh tra viên, công chức thanh tra chuyên ngành Kế hoạch và Đầu tư và cộng tác viên thanh tra ngành Kế hoạch và Đầu tư; trách nhiệm của các cơ quan, tổ chức cá nhân trong hoạt động thanh tra ngành Kế hoạch và Đầu tư.