Chánh Thanh tra Bộ chịu trách nhiệm trước Bộ trưởng, đồng thời chịu trách nhiệm trước Tổng Thanh tra Chính phủ và trước pháp luật trong việc thực hiện chức năng quản lý nhà nước về công tác thanh tra, giải quyết khiếu nại, tố cáo, phòng, chống tham nhũng trong phạm vi quản lý nhà nước của Bộ.

Chánh Thanh tra Bộ là người có năng lực tham mưu, tổ chức, thực hiện các chủ trương, chính sách của Đảng và pháp luật của Nhà nước về công tác thanh tra, giải quyết khiếu nại, tố cáo và phòng, chống tham nhũng. Có khả năng làm Trưởng các Đoàn thanh tra có quy mô lớn, diện rộng, nhiều tình tiết phức tạp và phải có năng lực điều hành và biết quy tụ, đoàn kết công chức, thanh tra viên. Đồng thời phải nắm vững kiến thức pháp luật và nghiệp vụ công tác thanh tra, giải quyết khiếu nại, tố cáo và phòng, chống tham nhũng; am hiểu các lĩnh vực thuộc chức năng quản lý nhà nước của Bộ và các lĩnh vực chuyên ngành khác có liên quan.

Chánh Thanh tra bộ phải có trình độ chuyên môn nghiệp vụ ngạch thanh tra viên chính hoặc tương đương trở lên; tốt nghiệp đại học trở lên, phù hợp với công tác thanh tra; tốt nghiệp lý luận chính trị cao cấp hoặc tương đương; tốt nghiệp quản lý hành chính nhà nước ngạch chuyên viên cao cấp; sử dụng được một ngoại ngữ thông dụng ở trình độ C và tương đương trở lên; sử dụng thành thạo máy tính và các trang thiết bị văn phòng phục vụ cho công tác.

Ngoài ra, Chánh Thanh tra Bộ phải là người đã qua thực tiễn công tác lãnh đạo, quản lý từ cấp Phó Chánh Thanh tra bộ và tương đương trở lên; có 05 năm trở lên công tác trong ngành thanh tra hoặc làm công tác quản lý nhà nước thuộc phạm vi quản lý của Bộ; không quá 55 tuổi đối với nam và không quá 50 tuổi đối với nữ khi được bổ nhiệm.

Thông tư này có hiệu lực kể từ ngày 27/10/2011.